我們正身處一個恐慌年代，在恐怖組織的威脅下，無人能夠獨善其身。為求捍衛社會安寧，ATF反恐團隊以強硬手段對付恐怖分子，麵對一次又一次的恐怖襲擊，絕不容忍妥協。
本劇共有20集，叛逃粵語版更新時間：每周一到周五22點半後開始更新粵語，國語一般次日更新，周六周末電視台停播，所以不更新。
以下是部分劇情介紹：
兄弟同心 化解危機
日本特種部隊SAT(Special Assault Team)傳來線報，指國際龍舟賽成為了恐怖分子的襲擊目標，ATF嚴陣以待。背負著警方臥底身份的古惑仔莊有正(陳展鵬飾)，奉黑幫之命，前往賽事場地放置計時炸彈，卻被身為SDU成員的弟弟莊有傑(吳卓羲飾)發現，窮追不舍。追捕期間，有傑意外落入恐怖分子手中，幸好有正及時迎救，兄弟攜手，配合ATF精妙布局，終成功拘捕恐怖分子，化解危機。
反恐訓練 各展所長
兩兄弟為警隊立下大功，隨即申請加入反恐部隊。受訓期間，有正表現出勇猛果敢，當機立斷性格，為求協助同伴，不惜違規受罰；有傑則著重團隊精神，嚴格遵從長官命令，全力執行獲委派的任務。盡管兩兄弟性格迥然，但二人合作無間與出色表現，得到上司肯定。
受訓完畢，有正和有傑分別被派往調查組和行動組，跟隨情報組總指揮沈誌敖(關禮傑飾)及行動組總指揮高威(黃德斌飾)進行反恐工作。無獨有偶，二人亦同時對ATF情報分析員鍾日嘉(陳茵媺飾)暗生情愫，分別對她展開追求。
秘密組織 密謀恐襲
ATF收到馬來西亞警方UTK部隊(Unit Tindakan Khas)，以及美國國土安全部(US DHS-U.S. Department of Homeland Security)的情報，得悉犯罪組織會將一批軍火運往香港，但ATF隻搜獲其中一部份，並懷疑其他失蹤軍火將被用於在港舉行的世貿會議。
專題記者葉婷(蒙嘉慧飾)曾經報導ATF的反恐訓練，因而認識有正。葉婷意外得知被竊軍火與恐怖組織「驚鳥」有關，暗中把情報交給有正，協助破案，二人因而建立出一段微妙關係。
ATF在追查之下，發現「驚鳥」不但與軍火失竊案有關，還正策劃另一宗更加駭人的毒氣彈恐怖襲擊。
機密外洩 有正遇害
為「驚鳥」製作毒氣彈的科學家王教授(李成昌飾)中途叛變，並要求ATF提供保護。有正負責護送王教授前往安全屋，但藏身地點外洩，「驚鳥」派人襲擊，有正雖然成功安排支援隊員救走王教授，自己卻被捉拿。「驚鳥」要脅以有正交換王教授，ATF拒絕，「驚鳥」一怒之下射殺有正，並透過電腦網絡將行刑片段傳送至ATF作為報複。
人心難測 誓找叛徒
日嘉因為目擊有正遇害，悲慟不已，有傑為使日嘉重新振作，不惜模仿有正的日常行為，日嘉大受感動，卻陷入感情矛盾之中。另一方麵，有傑調任情報調查員，接任有正的職位，欲找出有正被害真相。
ATF成員因有正被殺，安全屋機密外洩的事，掀起一場「內鬼」風波，反恐成員間互相猜疑，部隊團結力量麵臨重大考驗。相比恐怖組織，人心變壞更加恐怖
花絮，演員表：
《叛逃》 11年已拍完，擺足兩年都未上，雖然被指戲分不及陳展鵬，但吳卓羲為此劇拍到幾乎斷腳，咁搏都唔播，難怪唔開心
吳卓羲（Ron）、陳展鵬、蒙嘉慧（Yoyo）及陳茵媺等人昨日為無線新劇《ATF反恐》試造型，已離開無線一段時間的蒙嘉慧重返娘家拍劇，她表示現以部頭形式與無線合作，劇中她飾演一名記者，但背後仍有一份間諜工作，所以會用到不少古怪道具。Yoyo自作聰明四出找道具回來，可惜全被監製否決。她說：「我用百多元買了一枝筆，但內裡其實是一把劍，另外又買了有機關的手套，但監製都說太殘忍不合用。」Yoyo稱劇中都有打戲，笑言拍此劇可順道幫自己減肥。感情線方麵，問她是否與吳卓羲一對，Yoyo笑道：「不是，我像他家姐多些，我會跟陳展鵬一對，因為他較有滄桑味。」
2011年5月26日：此劇於12:30在將軍澳電視廣播城一廠灰位舉行試造型記者會。
2011年6月5日：此劇在沙田城門河拍攝外景。
2011年7月8日：此劇於15:00在將軍澳電視廣播城十三廠舉行開廠拜神儀式。
2011年9月20日：此劇正式煞科，於晚上舉行煞科宴。
部分演員表（飾演角色解析）
莊家
李司棋飾演唐淑芬 芬姐，展覽館職員，莊有正、莊有傑之母
陳展鵬飾演莊有正 Carson，刑事偵緝處警員，後為情報調查員，唐淑芬之長子，莊有傑之兄，鍾日嘉之男友，葉婷之暗戀對象
吳卓羲飾演莊有傑 特別任務連，後為行動組隊員、情報調查員，唐淑芬之次子，莊有正之弟，暗戀鍾日嘉
鍾家
李國麟飾演鍾禮謙 鍾日嘉之父
陳茵媺飾演鍾日嘉 Jessica，情報分析員，鍾禮謙之女，莊有正之女友，莊有傑之暗戀對象，葉婷之情敵
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